Le compte-rendu détaillé de la consécration de la cathédrale donne un aperçu des vitraux de Sainte-Marie, lorsqu’elle a été ouverte en 1857. Les trois fenêtres au-dessus de l’autel principal, les cinq fenêtres à lancettes inférieures (Saint Kieran, Saint Canice, Notre-Dame, Saint Jean et la scène de la crucifixion), et la fenêtre de la façade, au-dessus de la porte d’entrée, sont tous documentés comme étant en place lorsque la cathédrale fut consacrée le 4 octobre 1857. Les fenêtres des chapelles latérales – la chapelle de Notre-Dame et la chapelle Saint-Joseph – étaient également en place.

Il y a six fenêtres simples dans l’abside, à gauche et à droite. Des figures de prophètes sont représentées par Earley et Powell de Upper Camden Street, Dublin, la seule entreprise de ce type dans le pays dans les années 1880. La fenêtre du transept nord est également l’œuvre d’Earley et Powell – commandée par Daniel Cullen en mémoire de sa femme, Anastasia.